Kate dNA新功能：翻译时指定翻译表，导出串联重复序列为表格

看演示 。

像往常一样先载入 3个序列。

进行比对并且计算进化树 。

比对结果出来咯 。分别为每个序列指定起始、终止位置以及翻译表 。这里，关于位置的选项我们使用默认的。重点在翻译表的选择 ，有没有看到位置选择器的上方有个“Translation table:”选项？这就是选择翻译表的地方。需要针对每个序列选择翻译表 ，并且需要手动选择，程序目前无法为你推断出应当使用哪个翻译表。刚才本座是随便选的。

单击 “Find tandeam repeats and translate”按钮，以开始寻找串联重复序列和翻译成蛋白质。

计算完毕 。看看翻译出来的蛋白质序列。

另一个功能是导出串联重复序列为表格 。

有个新菜单 “Export”。按顺序单击 “Export”->“Tandem repeats”->“Spread sheets”。弹出一个对话框让你选择要将导出之后的表格文件放在哪个目录下 。在其中选好你要放置表格的目录 ，再单击“确定”。对话框关闭之后会马上执行导出动作 。所以现在已经导出完毕咯，去刚才选择的目录下去看看。在文件管理器中选中的 6个文件就是刚才导出的东西，因为一共有3个序列，每个序列分别使用Tandem Repeats Finder和Mreps计算过，所以一共有6个结果。随便打开一个看看吧 。由于这是 csv文件，并不能算是真正的表格文件，所以在你的操作系统中不一定会默认使用表格程序打开它。那种情况下 ，就单击右键，选择使用表格程序来打开它。看到没有 ？刚才本座选择的分隔符为“逗号”，这是csv文件使用的默认分隔符。表格程序会按照这个选项来将csv文件中的内容一个个分隔成单元格。表格看起来就是这个样子的 。你可以修改之后再自行保存成真正的表格格式。

完咯 。

录像可在这里观看： http://www.youtube.com/watch?v=TMTpiGBsIeo