StupidBeauty
Read times:1446Posted at:Tue May 3 21:07:53 2011
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Kate dNA新功能预览:使用PHYLIP软件包中的dnapars程序来计算进化树,使用其中的drawgram来绘制进化树

此文章来自 Kate dNA的勃客: http://stupidbeauty.com/KNA/2011/05/kate-dna%E6%96%B0%E5%8A%9F%E8%83%BD%E9%A2%84%E8%A7%88%EF%BC%9A%E4%BD%BF%E7%94%A8phylip%E8%BD%AF%E4%BB%B6%E5%8C%85%E4%B8%AD%E7%9A%84dnapars%E7%A8%8B%E5%BA%8F%E6%9D%A5%E8%AE%A1%E7%AE%97%E8%BF%9B/

看录像中的操作吧

启动 Kate dNA。

向里面填入 3个序列。

设置好它们参与比对的区间 ,进行初始的简单比对,以确定出最终要参与计算的部分。

选择要最终参与计算的起始 、结束 位置 。再按 “确定”,就开始计算咯。

看到下面的状态栏一直在变化吧 ?等待片刻。

应该已经好 咯,切换到 “DnaPars”标签页看看。

看到咯计算的结果 。这里是随意搞的3个序列,没有什么相关性,所以计算出来的结果就是3个序列的进化距离相同的。

下面完整操作一遍

看着。

完咯

录像在线观看 http://www.youtube.com/watch?v=RwFCAV7h1cs

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