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Read times:1077Posted at:Tue Mar 29 20:48:31 2011
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PHYLIP文档翻译:PHYLIP程序和文档,PHYLIP programs and documentation

v3.6

PHYLIP,系统发生推论软件包(PHYLogeny Inference Package),是由35 个程序组成的。针对每个程序 都有文档,文档是以HTML 3.2 格式的网页写成的。另外还有针对每组程序写的文档网页,以及一个简单介绍整个软件包的主文档 。在运行任何程序之前 ,你应当 读一读它

下面有一个关于程序和文档的列表。其中有到那些文档的超链接 ,都是带颜色的

PHYLIP简介

主文档

分子序列方法

分子序列程序组文档

protpars

蛋白质最大简约法 parsimony 文档

dnapars

DNA序列最大简约法文档

dnapenny

DNA最大简约法分支与定界文档

dnamove

交互式DNA最大简约法文档

dnacomp

DNA兼容性文档

dnaml

DNA最大似然法 likelihood )文档

dnamlk

带时钟的 DNA 最大似然法文档

proml

蛋白质序列最大似然法文档

promlk

带时钟的蛋白质序列最大似然法文档

dnainvar

DNA不变量方法 invariants )文档

dnadist

DNA距离法文档

protdist

蛋白质序列距离法文档

restdist

严格位点及分片距离法文档

restml

严格位点最大似然法文档

seqboot

自举 Bootstrapping /切割 Jackknifing )法文档

距离矩阵方法

距离矩阵程序组文档

fitch

Fitch-Margoliash距离矩阵方法文档

kitsch

带时钟的 Fitch-Margoliash 距离矩阵方法文档

neighbor

相邻位点连接法 ( Neighbor-Joining ) 和非加权组平均法 ( UPGMA )文档

基因频率和连续字符(continuous characters)

连续字符和基因频率程序组文档

contml

最大似然性连续字符和基因频率法文档

contrast

对比法文档

gendist

基因距离法文档

离散字符方法

离散字符方法程序组文档

pars

无序多态最大简约法文档

mix

混合方法最大简约法文档

penny

分支和定界混合方法最大简约法文档

move

交互式混合方法最大简约法文档

dollop

Dollo及 多态性最大简约法文档

dolpenny

Dollo及多态性分支定界最大简约法文档

dolmove

Dollo及多态性交互式最大简约法文档

clique

兼容 0/1 字符的方法文档

factor

字符重编码方法文档

树的绘制、重复序列、树的编辑、树的距离

树的编辑程序组文档

drawgram

有根树绘制程序文档

drawtree

无根树绘制程序文档

consense

重复序列树程序文档

treedist

树的距离程序文档

retree

交互式树重排程序文档

PHYLIP文档翻译:PHYLIP程序和文档,PHYLIP programs and documentation

v3.6

PHYLIP,系统发生推论软件包(PHYLogeny Inference Package),是由35 个程序组成的。针对每个程序 都有文档,文档是以HTML 3.2 格式的网页写成的。另外还有针对每组程序写的文档网页,以及一个简单介绍整个软件包的主文档 。在运行任何程序之前 ,你应当 读一读它

下面有一个关于程序和文档的列表。其中有到那些文档的超链接 ,都是带颜色的

PHYLIP简介

主文档

分子序列方法

分子序列程序组文档

protpars

蛋白质最大简约法 parsimony 文档

dnapars

DNA序列最大简约法文档

dnapenny

DNA最大简约法分支与定界文档

dnamove

交互式DNA最大简约法文档

dnacomp

DNA兼容性文档

dnaml

DNA最大似然法 likelihood )文档

dnamlk

带时钟的 DNA 最大似然法文档

proml

蛋白质序列最大似然法文档

promlk

带时钟的蛋白质序列最大似然法文档

dnainvar

DNA不变量方法 invariants )文档

dnadist

DNA距离法文档

protdist

蛋白质序列距离法文档

restdist

严格位点及分片距离法文档

restml

严格位点最大似然法文档

seqboot

自举 Bootstrapping /切割 Jackknifing )法文档

距离矩阵方法

距离矩阵程序组文档

fitch

Fitch-Margoliash距离矩阵方法文档

kitsch

带时钟的 Fitch-Margoliash 距离矩阵方法文档

neighbor

相邻位点连接法 ( Neighbor-Joining ) 和非加权组平均法 ( UPGMA )文档

基因频率和连续字符(continuous characters)

连续字符和基因频率程序组文档

contml

最大似然性连续字符和基因频率法文档

contrast

对比法文档

gendist

基因距离法文档

离散字符方法

离散字符方法程序组文档

pars

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混合方法最大简约法文档

penny

分支和定界混合方法最大简约法文档

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Dollo及多态性分支定界最大简约法文档

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树的绘制、重复序列、树的编辑、树的距离

树的编辑程序组文档

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