在windows系统下安装Kate dNA，以及使用录像. 2011.1.18版

由于录像程序崩溃咯好几次 ，所以这个录像被分成咯好几个部分，不完整。这段文字是完整的 ，所以你看看这段文字，再看看所有的几个录像，应该就完整咯。以后有时候再弄一段完整的录像 。

这次的录像在这里依次下载 ：

1. 1. http://stupidbeauty.com/Video/在windows系统下安装Kate%20dNA ，以及使用录像.2011.1.18版.0.mpeg.zip

2. 2. http://stupidbeauty.com/Video/在windows系统下安装Kate%20dNA ，以及使用录像.2011.1.18版.1.mpeg.zip

3. 3. http://stupidbeauty.com/Video/在windows系统下安装Kate%20dNA ，以及使用录像.2011.1.18版.2.mpeg.zip

4. 4. http://stupidbeauty.com/Video/在windows系统下安装Kate%20dNA ，以及使用录像.2011.1.18版.3.mpeg.zip

5. 5. http://stupidbeauty.com/Video/在windows系统下安装Kate%20dNA，以及使用录像.2011.1.18版.4.mpeg.zip

Kate dNA使用咯一些Perl脚本，所以额外需要一个Perl脚本的解释器，这里推荐的是ActivePerl，可在这里下载： http://downloads.activestate.com/ActivePerl/releases/5.12.2.1203/ActivePerl-5.12.2.1203-MSWin32-x86-294165.msi .

所以，在Windows系统中安装Kate dNA的过程有两步：

1. 1. 安装 ActivePerl；

2. 2.安装Kate dNA。

在这里 ，做咯一个详细的录像，希望以后很长一段时间都能起到教程的作用。

现在来安装 ActivePerl，假设你已经把ActivePerl的安装程序下载完咯。

运行它的安装程序。刚才喝水去咯 ，继续安装。现在看到的是安装程序的界面。从许可证是否接受到安装位置 ，这些都由你自己来选，本座不说咯。现在看到的这个屏幕是重点 。注意本座截的图：

看着这里 ， Add Perl to the PATH environment variable ,默认是选中状态，你让它保持选中状态就行咯。所以这里直接 “ 下一步 ”。 “安装”。再等着它安装完毕，或者做 些别的也可以。虚拟机比较慢 ，等3分钟。可能不需要等 3分钟。 1分钟到咯。果然还没安装完 ，再等1分钟。又 1分钟，还没安装完。继续等着 ，本座做点其它的准备工作。还没安装完 。

刚才本座为咯等下的录像的需要，将配置文件删除咯。

还没安装完 。快完咯 。再坚持一下。

刚才录像程序崩溃咯 ，现在继续录像。观众应当作好程序再次崩溃的准备。

虚拟机很慢 ，等一下，等它安装完。等。终于安装完咯 。

好咯 ，现在来安装Kate dNA。运行它的安装程序。

选择安装位置 。随便选吧，本座选的是不带空格的路径 。反正是有应用程序菜单的链接的 ，安装到哪里都行。

安装完咯 。

刚才又喝水去咯。

下面就来讲它的使用咯 。

如果你是初次安装 ，那么由于某个指定的地方没有配置文件 （刚才本座是手动把它删除咯），所以Kate dNA会弹出一个配置窗口让你对它进行一些初次的配置。看截图。

在应用程序菜单里面可以找到 Kate dNA。下面来运行它 ，并且看一下初次配置窗口的截图。

这个就是初次配置窗口的截图 。里面有 4个标签页：“常规”“视图”“Tandem Repeats Finder”“Mreps”。其中的前 2个是这里要讲的，在 “常规”中，目前有3个输入框，默认已经为你填好咯，可以不用改动它们。但是，记不记得前面本座说过那个 Add Perl to the PATH environment variable 要保持默认的选中状态 ？如果你没有让它保持默认的选中状态 ，那么你在这里就必须手动设置一下“Perl可执行程序”的内容，单击右边的“浏览”，找到ActivePerl软件目录中的“perl.exe”。下面 2个选项勒，如果你自己另外安装咯 Tandem Repeats Finder或者Mreps的话，可以手动改动这两个选项，否则的话， 实在没有必要改动 ，就使用Kate dNA自带的后端程序就行咯。总之，你一般地不需要改动这个标签页中的选项 。

第 2个标签页是“视图”，它只有一个选项 ：

这个用来设置最后显示的结果中的字体大小。等下你就知道结果中的字体大小是 指什么咯。在 Windows下面，最好把这个值设得大一些。本座这 把它滚成咯91.

第 3、4个标签页分别是针对目前所使用的2个后端程序的细节设置选项，是它们在运行起来寻找串联重复序列时的参数，这个，用户在使用一段时间后会有所了解，这里就不说咯，刚开始使用的时候，还是一样，保持默认状态就行咯。截2个图看看它们的配置选项长什么样。

继续 。

配置完咯之后，点击 “OK”。这个时候配置就生效咯 。

可以去找一段序列来测试一下咯 。

刚才本座修改系统时间的动作又导致录像程序停止工作咯 。现在继续。

本座演示完咯配置过程 ，就把它退出咯。因为虚拟机太慢咯，而且 Kate dNA已经被设计成在任何一个支持的操作系统中都是一样使用的 ，所以本座这次就不在虚拟机的 Windows里演示如何使用咯，直接在本座常用的操作系统中演示它的使用。

刚才录像程序又崩溃咯 ，继续。

先把虚拟机关咯 。虚拟机关咯之后你就会感觉到这个录像流畅起来咯 。好咯 ，关咯。

刚才录像程序又崩溃咯 ，这次把虚拟机关咯，应该不会再崩溃咯。继续 。

演示如何使用它 （Kate dNA） 。 让本座把它启动起来，你不用关心本座这里是如何启动它的，反正最终发布时，你将可以直接点击应用程序菜单中的链接来启动它。

在本座的机器上 ，它还是英文版的啊。一个样，用法没有区别。复制一个段序列到 “Sequence”标签（中文版中叫“序列”标签）中， 再单击“Find”按钮（中文版中是“查找”按钮）。

搞个鸟 ，它又崩溃咯。继续 。

把序列粘贴到窗口中 ，再按“查找”。

这个序列短 ，所以很快就有结果咯，看“Trf视图”“Mreps视图”2个标签页。

你可以拖动滚动条来看后面的序列 。

图中以白色填充的字符表示这是 “非串联重复”的背景序列，有颜色填充的是找到的串联重复序列。例如刚才拖动的 “GGGGGAG”就是一个串联重复序列，长度为7，重复单元是“G”，其中有1个错误（或者叫误 差更准确）。以不同的颜色区分不同的串联重复序列 。

目前它的界面就是这样的 ，以后会根据用户的反馈做调整。

你可以更改一 下“Tandem Repeats Finder”和“Mreps”的参数，看看结果会有什么不同。

教程就到这里咯 。